▲ Illumina NextSeq 2000
NextSeq™ 2000を用いたシークエンシング
GACHAでは、Illumina社の次世代シークエンサー「NextSeq 2000」を利用して、柔軟で高スループットなゲノム解析データを提供しています。
- 最大 18億リード（P4フローセルを使った時）
- RNA-seq、WES、WGS、scRNA-seqなど多様な用途に対応
- 迅速な納期と高精度なデータ品質
フローセルの種類と用途
| 種類 | リード数 | 推奨用途 | 対応リード長 |
|---|---|---|---|
| P1 | 最大1億リード | 小規模RNA-seqやampliconパネル | 100bp, 300bp, 600bp |
| P2 | 最大4億リード | 中規模RNA-seqやWES | 100bp, 200bp, 300bp, 600bp |
| P3 | 最大12億リード | 大規模RNA-seqやWGS | 100bp, 200bp, 300bp |
| P4 | 最大18億リード | scRNA-seqなど大量のリードが必要なプロジェクト | 50bp, 100bp, 200bp, 300bp |
NextSeq 2000では、4種類のフローセルを用途に応じて選択できます。
※ 対応リード長は paired-end の場合、Read1 + Read2 の合計値で表示しています。
サンプル要件
- サンプル形態：調製済みライブラリ
- 濃度：1 ng/µL以上（モル濃度4 nM以上）
- 必要量：15 µL以上
- 溶媒：Nuclease free water推奨
- 必要情報：インデックス情報、希望するリード長、ライブラリー調製に使用したキット名、希望データ量など
クオリティーチェック
受け取ったライブラリーは、シークエンシングを行う前に必ずクオリティーチェックを実施いたします。クオリティーチェックでは、ライブラリーの濃度測定、フラグメントサイズの確認などを行います。
| 区分 | クオリティーチェック料金（税込） |
|---|---|
| 学内者 | 11,100円 |
| 学外者（大学・公的機関） | 12,200円 |
| 学外者（一般） | 12,800円 |
※ 各区分の内容は以下になります。学内者：北海道大学に所属する教職員・学生、学外者（大学・公的機関）：国公私立大学、国公立研究機関、公益法人等に所属する方、学外者（一般）：上記以外の方（企業等）
シークエンシング料金
上記のクオリティーチェック料金に加えて、シークエンシング料金が必要となります。シークエンシング料金は、選択するフローセル（P1～P4）の種類、リード長により変動します。詳細はお問い合わせフォームよりご連絡ください。